超算云
AI智算云
返回列表研究目的
一個物種如何在群落中對這樣的生物環(huán)境做出反應，最終導致其進化，一直是生態(tài)進化生物學家們感興趣的話題。我們研究了兩種細菌共培養(yǎng)過程中的相互作用。我們通過全基因組測序確定了大量的單核苷酸多態(tài)性(SNPs)，作為預測表型性狀變異的遺傳標記。應用全基因組關聯(lián)研究(GWAS)確定了控制兩個物種間競爭的基因座。在大腸桿菌中，與共培養(yǎng)菌株相比，顯著SNPs會影響最大生長率的變化，部分顯著SNPs也會影響了單培養(yǎng)菌株和共培養(yǎng)菌株最大生長率的變化。
平臺使用&研究方法
利用超算云平臺研究了大腸桿菌和金黃色葡萄球菌的表型可塑性，兩種微生物在單培和共培養(yǎng)條件下的相互作用。在面對環(huán)境變化時，物種間的相互作用不僅會引起物種豐度和分布的生態(tài)變化，還會影響組成物種的進化，這進而影響生態(tài)系統(tǒng)的功能。在超算云平臺的超級計算機幫助下，通過構建數(shù)理、工程及生命科學模型對兩種微生物單培、共配條件下的豐度進行分析。
